Ο Γερμανός θρύλος, βρίσκεται υπό διερεύνηση στο γενικότερο πλαίσιο της κάθαρσης της FIFA και της τιμωρίας όσον παραβίασαν αρχές και κανονισμούς εις βάρος του ποδοσφαίρου και της Ομοσπονδίας τα προηγούμενα χρόνια.

Η γερμανική «Spiegel Online», επιβεβαίωσε από εκπρόσωπο Τύπου της Εισαγγελίας της Ελβετίας, πως διεξάγεται μεγάλη έρευνα στις καταγγελίες που βαραίνουν τον Μπεκενμπάουερ.

Ο άλλοτε επικεφαλής της επιτροπής που είχε συσταθεί από τους Γερμανούς για την ανάληψη της διεξαγωγής του Μουντιάλ του 2006, θεωρείται ύποπτος για ξέπλυμα χρήματος και δωροδοκίες που έφτασαν στα 9 εκατ.ευρώ (από το 2002 έως το 2005), ώστε να βγει νικήτρια η υποψηφιότητα της χώρας του για το προ δεκαετίας, Παγκόσμιο Κύπελλο.