Του δόθηκε η δουλειά τον Μάιο του 2013, όταν και αντικατέστησε τον Τόνι Πιούλις και ο Μάρκ Χιουζ κατάφερε να οδηγήσει τη Στόουκ στην 9η θέση, την καλύτερη της ιστορία της στην Premier League. Επόμενο ήταν του δοθεί παράταση στο τιμόνι των Πότερς έως και το 2016. Καθώς όμως ο 51χρονος τεχνικός συνεχίζει να εντυπωσιάζει, έχοντας και φέτος την ομάδα στην 9η θέση, πήρε και νέο συμβόλαιο, υπογράφοντας έως το 2018.